Rimozione NA nel tubo dplyr

Question

Ho provato a rimuovere NA dal sottoinsieme utilizzando le pipe dplyr. La mia risposta è un'indicazione di un passaggio mancato. Sto cercando di imparare a scrivere le funzioni utilizzando dplyr:

> outcome.df%>% 
+ group_by(Hospital,State)%>% 
+ arrange(desc(HeartAttackDeath,na.rm=TRUE))%>% 
+ head() 
Source: local data frame [6 x 5] 
Groups: Hospital, State 

 
          Hospital State HeartAttackDeath 
1  ABBEVILLE AREA MEDICAL CENTER SC    NA 
2  ABBEVILLE GENERAL HOSPITAL LA    NA 
3  ABBOTT NORTHWESTERN HOSPITAL MN    12.3 
4 ABILENE REGIONAL MEDICAL CENTER TX    17.2 
5  ABINGTON MEMORIAL HOSPITAL PA    14.3 
6 ABRAHAM LINCOLN MEMORIAL HOSPITAL IL    NA 
Variables not shown: HeartFailureDeath (dbl), PneumoniaDeath 
    (dbl) 

Answer 1

Non credo desc prende un argomento na.rm ... Sono davvero sorpreso che non genera un errore quando si dammelo. Se si desidera solo per rimuovere NA s, utilizzare na.omit:

outcome.df %>% 
    na.omit() %>% 
    group_by(Hospital, State) %>% 
    arrange(desc(HeartAttackDeath)) %>% 
    head() 

Se si desidera rimuovere NA s dalla colonna HeartAttackDeath, filtro con is.na:

outcome.df %>% 
    filter(!is.na(HeartAttackDeath)) %>% 
    group_by(Hospital, State) %>% 
    arrange(desc(HeartAttackDeath)) %>% 
    head() 

Come osservato in vittima, È anche possibile utilizzare complete.cases, ma è un po 'più complicato inserire una catena perché accetta un frame di dati come argomento ma restituisce un vettore di indice. Quindi potresti usarlo in questo modo:

outcome.df %>% 
    filter(complete.cases(.)) %>% 
    group_by(Hospital, State) %>% 
    arrange(desc(HeartAttackDeath)) %>% 
    head()