Utilizzo del pacchetto di compilazione e soppressione "Nessuna associazione visibile per la variabile globale"

Question

Uso la R 3.0.2 su Ubuntu 14. Eseguo alcuni calcoli pesanti nel mio codice e ho provato il pacchetto "compiler" con

compilePKGS(enable=TRUE) 
enableJIT(3) 

E sembra velocizzare il mio codice. Molto bella!

Ma ogni volta il mio pacchetto permette al "compilatore", ho un sacco di note come

Note: no visible binding for global variable '.Data' 

o qualcosa di simile con i miei oggetti S4 (la sua "obj risultato @" nel codice):

Note: no visible binding for global variable 'result' 

che è, ad esempio, parte di un oggetto S4 creato da sé. L'aggiunta di setCompilerOptions("suppressAll", TRUE) o setCompilerOptions("suppressUndefined", TRUE) non ha aiutato. Quando disattivo completamente il pacchetto del compilatore, non appaiono affatto note, quindi questo potrebbe essere un problema con la mia comprensione del pacchetto compilatore/jit?

Cosa posso fare per sopprimere queste note?

Edit:

require(compiler) 
compilePKGS(enable=TRUE) 
enableJIT(3) 



setClass(Class = "testobject", 
     slots = c(data  = "numeric", 
        test  = "character", 
        split = "numeric", 
        name  = "character" 
     ) 
) 

a <- new("testobject", data=c(1,2,3,4), test="TEST", split=5, name="NAME") 

for(i in a@data){ 
    print(i) 
} 

Semplice esempio produce

Note: no visible binding for global variable '.Data' 
Note: no visible binding for global variable '.Data' 

direttamente dopo la definizione della classe chiamata

Answer 1

È possibile eliminare queste note da R utilizzando

setCompilerOptions(suppressAll = TRUE)

Non è necessario sopprimere separatamente le opzioni "indefinite", eliminando "tutto". In alternativa, è possibile impostare la variabile di ambiente

export R_COMPILER_SUPPRESS_ALL=true (o in modo simile in sistemi operativi diversi).

Se si voleva sopprimere solo avvertimenti sulle variabili che sono o sembrano essere undefined al compilatore, si può fare

setCompilerOptions(suppressUndefined=TRUE)

E se si voleva fare questo solo per la variabile .Data, è possibile do

setCompilerOptions(suppressUndefined=".Data").

Nota inoltre non è necessario abilitare la compilazione di pacchetti quando si utilizza il compilatore per accelerare il codice, tutto ciò che è necessario è abilitare il JIT.Puoi farlo da R come nel tuo esempio, o semplicemente impostando un'altra variabile

export R_ENABLE_JIT=3

Per abilitare ottimizzazioni più aggressive, è possibile anche impostare

export R_COMPILER_OPTIMIZE=3

o da R eseguire setCompilerOptions(optimize=3)

Quando si abilita la compilazione JIT tramite la variabile di ambiente, non è necessario caricare esplicitamente il pacchetto del compilatore - verrà eseguito automaticamente.

Answer 2

È possibile definire una variabile globale utilizzando, ad esempio

utils::globalVariables(".Data") 

Questo consentirà di evitare il "no visibile vincolante per la variabile globale" NOTA.

Questo ha il vantaggio di sopprimere tutti i messaggi del compilatore a cui è destinato; non sopprimerai altri, utili, messaggi del compilatore.