Utilizzo di `fread` per importare il file csv da un archivio in` R` senza estrarlo sul disco

Question

Ho un archivio zip con diversi file csv al suo interno. Vorrei usare fread per importare file csv selezionati in R.

Con read.csv Posso ottenere i dati come segue senza estrarre l'archivio.

con <- unz("myarchive.zip", "file2.csv") 
file2 <- read.csv(con, header=T, sep=",", stringsAsFactors = FALSE) 
on.exit(close(con)) 

Come utilizzare data.table::fread per importare i dati nel file CSV in R dall'archivio, senza estrarlo?

Answer 1

fread possibile eseguire comandi di shell di pre-elaborazione del file, così come informazioni su Linux funziona:

write.csv(mtcars, 'mtcars.csv') 
zip('mtcars.csv.zip', 'mtcars.csv') 
# adding: mtcars.csv (deflated 52%) 
fread('unzip -cq mtcars.csv.zip') 
#      V1 mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb 
# 1:   Mazda RX4 21.0 6 160.0 110 3.90 2.620 16.46 0 1 4 4 
# 2:  Mazda RX4 Wag 21.0 6 160.0 110 3.90 2.875 17.02 0 1 4 4 
# 3:   Datsun 710 22.8 4 108.0 93 3.85 2.320 18.61 1 1 4 1 
# 4:  Hornet 4 Drive 21.4 6 258.0 110 3.08 3.215 19.44 1 0 3 1 
# 5: Hornet Sportabout 18.7 8 360.0 175 3.15 3.440 17.02 0 0 3 2 
# 6:    Valiant 18.1 6 225.0 105 2.76 3.460 20.22 1 0 3 1 
# 7:   Duster 360 14.3 8 360.0 245 3.21 3.570 15.84 0 0 3 4 
# 8:   Merc 240D 24.4 4 146.7 62 3.69 3.190 20.00 1 0 4 2 
# 9:   Merc 230 22.8 4 140.8 95 3.92 3.150 22.90 1 0 4 2 
# 10:   Merc 280 19.2 6 167.6 123 3.92 3.440 18.30 1 0 4 4 
# 11:   Merc 280C 17.8 6 167.6 123 3.92 3.440 18.90 1 0 4 4 
# 12:   Merc 450SE 16.4 8 275.8 180 3.07 4.070 17.40 0 0 3 3 
# 13:   Merc 450SL 17.3 8 275.8 180 3.07 3.730 17.60 0 0 3 3 
# 14:   Merc 450SLC 15.2 8 275.8 180 3.07 3.780 18.00 0 0 3 3 
# 15: Cadillac Fleetwood 10.4 8 472.0 205 2.93 5.250 17.98 0 0 3 4 
# 16: Lincoln Continental 10.4 8 460.0 215 3.00 5.424 17.82 0 0 3 4 
# 17: Chrysler Imperial 14.7 8 440.0 230 3.23 5.345 17.42 0 0 3 4 
# 18:   Fiat 128 32.4 4 78.7 66 4.08 2.200 19.47 1 1 4 1 
# 19:   Honda Civic 30.4 4 75.7 52 4.93 1.615 18.52 1 1 4 2 
# 20:  Toyota Corolla 33.9 4 71.1 65 4.22 1.835 19.90 1 1 4 1 
# 21:  Toyota Corona 21.5 4 120.1 97 3.70 2.465 20.01 1 0 3 1 
# 22: Dodge Challenger 15.5 8 318.0 150 2.76 3.520 16.87 0 0 3 2 
# 23:   AMC Javelin 15.2 8 304.0 150 3.15 3.435 17.30 0 0 3 2 
# 24:   Camaro Z28 13.3 8 350.0 245 3.73 3.840 15.41 0 0 3 4 
# 25: Pontiac Firebird 19.2 8 400.0 175 3.08 3.845 17.05 0 0 3 2 
# 26:   Fiat X1-9 27.3 4 79.0 66 4.08 1.935 18.90 1 1 4 1 
# 27:  Porsche 914-2 26.0 4 120.3 91 4.43 2.140 16.70 0 1 5 2 
# 28:  Lotus Europa 30.4 4 95.1 113 3.77 1.513 16.90 1 1 5 2 
# 29:  Ford Pantera L 15.8 8 351.0 264 4.22 3.170 14.50 0 1 5 4 
# 30:  Ferrari Dino 19.7 6 145.0 175 3.62 2.770 15.50 0 1 5 6 
# 31:  Maserati Bora 15.0 8 301.0 335 3.54 3.570 14.60 0 1 5 8 
# 32:   Volvo 142E 21.4 4 121.0 109 4.11 2.780 18.60 1 1 4 2 
#      V1 mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb