Confronto relazionale lento NaN in MATLAB

Question

Sembra che eseguire operazioni relazionali numeriche (maggiore di, minore di) su NaN sia 10 volte più lento rispetto a non NaN in MATLAB R2013a (versione 8.1).

>> a = rand(10000); 
>> b = NaN(size(a)); 

>> tic; a>0; toc 
Elapsed time is 0.083838 seconds. 

>> tic; b>0; toc 
Elapsed time is 0.991742 seconds. 

Alcuni esperimenti mostra il tempo impiegato scale con la proporation di NaN nella matrice, in modo tale che una matrice di tutti NaNs prende lunga e tutte non NaNs è più rapido. Gli inf sono veloci quanto i non-NaN.

Sto facendo confronti su array con un gran numero di NaN. Per rallentare questo rallentamento, sto sostituendo i NaN nei miei array con Infs (ad esempio -Inf se stavo facendo b> 0). Questo aiuta, ma la sostituzione stessa è lenta. Effettivamente è solo perché sto facendo molti confronti simili sullo stesso array che la sostituzione one-off aiuta nel complesso.

Quindi la mia domanda è: qualcuno ha qualche idea migliore per confrontarsi con molti NaN?

Answer 1

Sto usando Matlab R2014a e l'ora è la stessa. Tuttavia, suggerisco di fare quanto segue per vedere se funziona: tic; c = isnan (b); toc;

Ciò consente di trasformare la matrice di NaN in una matrice di logica, dove "true" significa che è un NaN. La nuova matrice sarà più veloce di quella vecchia e dovrai semplicemente ridefinire il tuo confronto. Ad esempio, se si dispone di una matrice "A" contenente numeri e NaN e si desidera trovare numeri maggiori di 0, si avrà:

A = myMatrix; 

% The inverse sign "~" means that "true" is a number, while "false" is a nan 
B = ~isnan(A); 

% Greater than 0 for non-nan 
C = B & A>0