Sono stato alle prese con questo problema per un po 'di tempo. Quando installo rJava da R, richiede Java 1.6 anziché 1.8. Sto usando MAC OS 10.8.5 e questi sono i passaggi che ho già fatto.rJava non sta rilevando la versione Java corretta
Ho installato R.
Ho entrambi Java 1.6 e 1.8 sulla mia macchina.
Ho riconfigurato R dal terminale utilizzando: sudo R CMD javareconf -n
.
Ecco ciò che il risultato è simile:
Java interpreter : /usr/bin/java Java version : 1.8.0_25 Java home path : /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_25.jdk/Contents/Home/jre Java compiler : /usr/bin/javac Java headers gen.: /usr/bin/javah Java archive tool: /usr/bin/jar Non-system Java on OS X
cercando di compilare e collegare un progamma JNI
detected JNI cpp flags : -I$(JAVA_HOME)/../include -I$(JAVA_HOME)/../include/darwin detected JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/lib/server -ljvm gcc -arch x86_64 -std=gnu99 -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG -I/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_25.jdk/Contents/Home/jre/../include -I/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_25.jdk/Contents/Home/jre/../include/darwin -I/usr/local/include -fPIC -mtune=core2 -g -O2 -c conftest.c -o conftest.o gcc -arch x86_64 -std=gnu99 -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names -undefined dynamic_lookup -single_module -multiply_defined suppress -L/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib -L/usr/local/lib -L/usr/local/lib -o conftest.so conftest.o -L/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_25.jdk/Contents/Home/jre/lib/server -ljvm -F/Library/Frameworks/R.framework/.. -framework R -Wl,-framework -Wl,CoreFoundation JAVA_HOME : /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_25.jdk/Contents/Home/jre Java library path: $(JAVA_HOME)/lib/server JNI cpp flags : -I$(JAVA_HOME)/../include -I$(JAVA_HOME)/../include/darwin JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/lib/server -ljvm
Poi sono andato su a R e installato il pacchetto Rjava come sorgente in questo modo: install.packages("rJava", type="source")
e arrivo a DONE(rJava)
quindi quando controllo la versione utilizzando:
library(rJava) .jinit() .jcall("java/lang/System", "S", "getProperty", "java.runtime.version")
ho ancora 1.6.0_25-b17
invece di 1.8
Per favore fatemi sapere se si conosce la soluzione a questo.
Avete provato 'opzioni (java.home ="/percorso/a/java ")'? –
'javareconf -n' non fa nulla -' -n' dice di non apportare modifiche (vedere la documentazione R) –