shapefile di output per la rete IGRAPH in R

Question

Ciao Ho una rete in R utilizzando la libreria IGRAPH

Vertices: 616 
Edges: 6270 
Directed: TRUE 
No graph attributes. 
Vertex attributes: name, Lat, Lon. 
Edge attributes: V3. 

Come faccio a generare due shapefile per i vertici e gli spigoli utilizzando le informazioni Lat, Lon nel vertice ?

Answer 1

È possibile farlo utilizzando i pacchetti sp e maptools. Ci sono pratici funzioni writePointsShape() e writeLinesShape() in maptools che scriverà nel formato shapefile ESRI.

Prima di eseguire questa operazione, è necessario estrarre l'informazione lat/lon dai vertici del grafico e inserirla in un oggetto SpatialPoints per i vertici e un oggetto SpatialLinesDataFrame per i bordi.

Questo codice produce una molto semplice igraph oggetto per il seguente esempio:

library(igraph) 

## Produce a ring graph with 4 vertices 
x <- graph.ring(4) 

## Add lat/lon information to vertices 
V(x)$lat <- c(50, 50, 51, 51) 
V(x)$lon <- c(40, 41, 41, 40) 

Ora, creare l'oggetto SpatialPoints per i vertici

library(sp) 
library(maptools) 

## Create SpatialPoints object containing coordinates 
xV <- SpatialPoints(cbind(V(x)$lon, V(x)$lat)) 

## Write vertices to a shapefile 
writePointsShape(xV, fn="vertices") 

Infine, creare l'oggetto SpatialLinesDataFrame per i bordi. Questo è un po 'disordinato, ma devo ancora trovare un modo rapido per produrre le coordinate di un oggetto SpatialLines.

## Create SpatialLinesDataFrame object describing edges 
edges <- get.edgelist(x)+1 
edges <- cbind(edgeNum=1:nrow(edges), v1=edges[,1], v2=edges[,2]) 
xE <- apply(edges, 1, function(i) Lines(Line(cbind(c(V(x)$lon[i["v1"]], V(x)$lon[i["v2"]]), c(V(x)$lat[i["v1"]], V(x)$lat[i["v2"]]))), ID=as.character(i["edgeNum"]))) 
xE <- SpatialLinesDataFrame(SpatialLines(xE), data=data.frame(edgeNum=1:nrow(edges))) 

## Write edges to a shapefile 
writeLinesShape(xE, fn="edges")