Il selenio è un framework di automazione web. Ti permette di scrivere codice che "guida" un browser, quindi puoi automatizzare facendo clic su un sito, compilando moduli, ecc ...
FitNesse è un framework di test di accettazione - è uno strumento per documentare i test di accettazione come testabili codice. Puoi eseguire i test e vedere se superano o falliscono.
i due sono complementari gli uni agli altri - non c'è bisogno di usare selenio con FitNesse o viceversa, ma per i siti web di test, è bene avere le prove di collaudo scritti in FitNesse (o un quadro simile) e hanno loro usano Selenium per guidare un browser.