Scala R Bilancia dell'asse Y troppo corta

Question

Sto provando a generare un barplot, ma la scala dell'asse y è troppo corta. Qui è il mio codice:

barplot(as.matrix(dat), log="y", ylim=c(10000,100000000), beside=TRUE, 
     ylab = "Number of reads", col = c("gray","black","white")) 

lascia la stanza per l'asse (come da ylim), ma non riempie l'asse reale. Ho provato il barplot e ho provato alcune cose (da google su Google ho pensato che lo xpd = F, yaxs = c(10000,10000000,5 avrebbe dovuto funzionare, ma non è stato così).

So che è una cosa da poco, ma è esattamente il tipo di problema su cui mi blocco da anni, invece di lavorare, quindi qualsiasi aiuto sarebbe molto apprezzato!

Modifica: Cheers per l'ingresso ragazzi!

Ho inizialmente tracciato senza ylim, ma finisce con un asse ancora più bizzarro (con lo stesso problema); Ho effettivamente scelto i miei valori ylim per dargli un asse più distanziato.

Ecco i dati:

dat <- read.table(text="D2,D3n,D3m,D4n,D4m 
21234722,34262282,31920464,25486357,20712943 
35343,64403,22537,39934,46547 
126646,312286,101105,81537,76944", header=TRUE, sep=",") 

Edit 2: @DWin aveva ragione - ho aggiornato il mio R, ed ora trame bene - grazie a tutti!

Answer 1

Vedo che provi a impostare ylim in modo errato fornisci valori errati. Questo cambierà la scala della trama (come uno zoom) Ad esempio questa:

par(mfrow=c(2,1)) 
tN <- table(Ni <- stats::rpois(100, lambda = 5)) 
r <- barplot(tN, col = rainbow(20),ylim=c(0,50),main='long y-axis') 
r <- barplot(tN, col = rainbow(20),main='short y axis') 

Un'altra opzione è quella di tracciare senza assi, e impostare manualmente tramite axis e usr:

require(grDevices) # for colours 
par(mfrow=c(1,1)) 
r <- barplot(tN, col = rainbow(20),main='short y axis',ann=FALSE,axes=FALSE) 
usr <- par("usr") 
par(usr=c(usr[1:2], 0, 20)) 
axis(2,at=seq(0,20,5)) 

Answer 2

barplot(data) 

barplot(data, yaxp=c(0, max(data), 5)) 

yaxp = c (Miny assi, maxy-asse, intervallo)