2016-01-11 46 views
7

ConModifica singoli ggplot in GGally :: ggpairs: come posso avere la trama della densità non compilata in ggpairs?

library(GGally) 

data(diamonds, package="ggplot2") 
diamonds.samp <- diamonds[sample(1:dim(diamonds)[1],200),] 

# Custom Example 
ggpairs(
diamonds.samp[,1:5], 
mapping = ggplot2::aes(color = cut), 
upper = list(continuous = wrap("density", alpha = 0.5), combo = "box"), 
lower = list(continuous = wrap("points", alpha = 0.3), combo = wrap("dot", alpha = 0.4)), 
diag = list(continuous = wrap("densityDiag")), 
title = "Diamonds" 
) 

ottengo

enter image description here

Come faccio a rendere le trame densità diagonali di non essere riempiti, e mostrare solo le linee?

Tipo di lavori ... ma non proprio.

Questo è davvero brutto - in termini di codice - perché non ha alcun senso per me. Inoltre, non funziona qui, perché cambia anche gli istogrammi.

ggpairs(
    diamonds.samp[,1:5], 
    mapping = ggplot2::aes(color = cut), 
    upper = list(continuous = wrap("density", alpha = 0.5), combo = "box"), 
    lower = list(continuous = wrap("points", alpha = 0.3), combo = wrap("dot", alpha = 0.4)), 
    diag = list(continuous = wrap("densityDiag"), mapping = ggplot2::aes(fill=carat)), 
    title = "Diamonds" 
) 

enter image description here

+0

anche vedere https://github.com/bbolker/stat744/ blob/master/conferenze/explore_multiway.R # L109 –

risposta

9

La risposta alla domanda sono disponibili sul https://cran.r-project.org/web/packages/GGally/vignettes/ggpairs.html (archived here)

ggally_mysmooth <- function(data, mapping, ...){ 
    ggplot(data = data, mapping=mapping) + 
    geom_density(mapping = aes_string(color="cut"), fill=NA) 
} 
ggpairs(
    diamonds.samp[,1:5], 
    mapping = aes(color = cut), 
    upper = list(continuous = wrap("density", alpha = 0.5), combo = "box"), 
    lower = list(continuous = wrap("points", alpha = 0.3), combo = wrap("dot", alpha = 0.4)), 
    diag = list(continuous = ggally_mysmooth), 
    title = "Diamonds" 
) 

enter image description here

+1

Quella pagina collegata è scomparsa, fortunatamente la Wayback Machine ha https: //web.archive .org/web/20160320034441/cran.r-project.org/web/pacchetti/GGally/vignette/ggpairs.html – JimLohse