Graphviz DOT organizzare nodi nei circoli, il layout troppo "compatto"

Question

Sono a metà strada si prega di vedere la modifica

OK ecco il mio problema, sto generando un grafico di un modulo Python, inclusi tutti i file con le loro funzioni/metodi/classi.

Voglio sistemarlo in modo che i nodi si raccolgano in circolo attorno ai loro nodi genitori, attualmente tutto è su una fila orizzontale gigantesca, il che rende la cosa> 50k pixel di larghezza e anche il convertitore svg fallisce (restituisce solo il metà del grafico).

Ho passato il docs ma non ho trovato nulla che sembra fare il trucco.

Quindi la domanda è:
C'è un modo semplice per farlo o devo eseguire il layout di tutto da solo? :/

EDIT:
Grazie alla Andrews commento ho il layout di destra, l'unico problema ora è che è un po 'a "compact" ... così la domanda ora è, come risolvere questo problema ?

Answer 1

ho accennato tutti i parametri più significativi che influenzano il layout corrente e quindi valori di tali parametri suggeriti. Tuttavia, ho il sospetto che tu possa ottenere il layout che desideri semplicemente applicando un paio di questi suggerimenti.

• ridurre il peso bordo, ad esempio, [peso = 0,5]; ciò renderà i bordi dello più lunghi, causando i cluster corretti che si vedono attualmente nel grafico in "ventaglio".

• eliminare i bordi del nodo, node_A [colore = nessuno; Forma = crittografato]; , in particolare per i nodi di forma ovale, una frazione significativa dello spazio dei nodi è "inutilizzata" (ovvero non viene utilizzato per visualizzare l'etichetta del nodo).

• impostare esplicitamente la dimensione del carattere per i nodi (i bordi di nodo sono allargata in modo che circondano il testo nodo, il che significa che il font dimensioni e la quantità di testo per un dato nodo comprende una effetto significativo sulla sua dimensione ); [fontsize = 11] dovrebbe essere grande sufficiente per essere leggibile, ma anche ridurre l'aspetto 'ingombro' (la dimensione predefinita di è 14).

• aumentare la separazione minima tra i nodi , tramite 'nodesep'; ad esempio, nodesep = 2.0; questo sarà indirizzo direttamente la tua obiezione per quanto riguarda il tuo grafico "troppo compatto." ('nodesep' e 'ranksep' probabilmente influenzano il modo in cui il punto disegna un grafico più di qualsiasi altro parametro per il nodo, il bordo o il grafico .Nel tuo caso, sembra che tu abbia solo due ranghi di nodi; 'Ranksep' imposta la distanza minima tra i nodi di diversi ranghi - sembra che tutti i nodi che compongono il grafico sono dello stesso valore (tranne che per poche livello superiore nodi nei centri).

• esplicitamente impostare formato grafico totale, ad esempio, size = "7.75,10.25" (assicura che il grafico si inserisce in una pagina 8,5 x 11 e che occupa l'intero spazio)

• E un suggerimento puramente estetico che al massimo aiuterà solo il tuo apparire meno ingombrante: il fontcolor predefinito per entrambi i bordi e i nodi è nero. La maggior parte della macchia sul grafico è da questi due strutture (in particolare se si rimuovere i bordi dei nodi), quindi vorrei per esempio impostare il nodo (testo) fontcolor o fontcolor bordo di "blu" per aiutare l'occhio distinguere le due serie di strutture di grafico .

Answer 2

Se è troppo compatto, vorrai rovinare la lunghezza del bordo. Hai un paio di opzioni a seconda del layout grafico:

1. Se il layout è SFDP o FDP, modificare il grafo proprietà K. Il valore predefinito è 0.3.
2. Per neato (o fdp), modificare il bordo proprietà len. L'impostazione predefinita è 1.0 per neato e 0.3 per fdp.
3. Per il punto è possibile utilizzare il bordo proprietà minlen che è la lunghezza minima del bordo. L'impostazione predefinita è 1.

Si potrebbe anche voler fare confusione con la proprietà del grafico modello che determina il comportamento di clustering. In particolare, prova sottoinsieme. Credo che questo si occupa len per voi: http://www.graphviz.org/doc/info/attrs.html#d:model

Inoltre, è possibile eliminare le sovrapposizioni tutti insieme con le tecniche di scaling: http://www.graphviz.org/doc/info/attrs.html#d:overlap