fondersi con SpatialPolygonsDataFrame

Question

voglio unire un SpatialPolygonsDataFrame:

# From https://www.census.gov/geo/maps-data/data/cbf/cbf_state.html 
states <- readOGR(dsn = "./cb_2014_us_state_20m.shp", 
        layer = "cb_2014_us_state_20m", verbose = FALSE) 

con una normale cornice di dati:

my_counts <- data.frame(
    State = c(
    "CA", "TX", "IL", "FL", "NY", "OH", 
    "NJ", "GA", "MI", "PA", "MA", "CO", "AZ", "NC", "VA", "WA", "IN", 
    "MD", "MN", "WI", "MO", "TN", "IA", "KY", "LA", "SC", "CT", "AL", 
    "KS", "OR", "OK", "AR", "NV", "UT", "NE", "ID", "MS", "DC", "NM", 
    "NH", "ME", "AK", "RI", "MT", "HI", "WV", "SD", "ND", "DE", "VT", 
    "WY", "PR", "GU", "VI", "MP", "AS", "na", "MH", "FM", "PW" 
), 
    count = c(
    1590533L, 1016328L, 754535L, 742603L, 714205L, 
    538719L, 477278L, 452064L, 437162L, 428616L, 420332L, 391084L, 
    380853L, 354601L, 342533L, 335505L, 294670L, 286026L, 273427L, 
    246172L, 238968L, 236037L, 235030L, 209514L, 199013L, 191707L, 
    185521L, 179931L, 163477L, 159862L, 142610L, 136006L, 120111L, 
    117338L, 112671L, 106176L, 102564L, 100168L, 97496L, 69881L, 
    69508L, 68684L, 65631L, 62109L, 61123L, 57300L, 57254L, 56091L, 
    51696L, 33944L, 32136L, 4822L, 598L, 468L, 49L, 19L, 17L, 
    11L, 2L, 1L 
) 
) 

L'obiettivo è quello di utilizzare il risultato di fare una mappa con leaflet

Ho provato sp :: merge

df1 <- sp::merge(x= states, y=my_counts) 

ma ottengo un errore:

Error in table(y[, by.y]) : attempt to set an attribute on NULL 

Answer 1

Caveat: Non ho mai fatto prima, quindi sono "sentendo il mio modo intorno". Primo sguardo all'oggetto- states:

Nota: questo era con rgdal_0.9-3 e sp_1.1-1 caricato in R 3.2.1 (e con GDAL installato sul mio sistema OSX, da kingchaos, IIRC):

> str(states) 
Formal class 'SpatialPolygonsDataFrame' [package "sp"] with 5 slots 
    ..@ data  :'data.frame': 52 obs. of 9 variables: 
    .. ..$ STATEFP : Factor w/ 52 levels "01","02","04",..: 5 9 10 11 13 14 16 18 19 21 ... 
    .. ..$ STATENS : Factor w/ 52 levels "00068085","00294478",..: 22 17 2 18 27 28 29 30 16 19 ... 
    .. ..$ AFFGEOID: Factor w/ 52 levels "0400000US01",..: 5 9 10 11 13 14 16 18 19 21 ... 
    .. ..$ GEOID : Factor w/ 52 levels "01","02","04",..: 5 9 10 11 13 14 16 18 19 21 ... 
    .. ..$ STUSPS : Factor w/ 52 levels "AK","AL","AR",..: 5 8 10 11 14 15 13 18 19 21 ... 
    .. ..$ NAME : Factor w/ 52 levels "Alabama","Alaska",..: 5 9 10 11 13 14 16 18 19 21 ... 
    .. ..$ LSAD : Factor w/ 1 level "00": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ... 
    .. ..$ ALAND : num [1:52] 4.03e+11 1.58e+08 1.39e+11 1.49e+11 2.14e+11 ... 
    .. ..$ AWATER : num [1:52] 2.05e+10 1.86e+07 3.14e+10 4.95e+09 2.40e+09 ... 
    ..@ polygons :List of 52 
    .. ..$ :Formal class 'Polygons' [package "sp"] with 5 slots 
    .. .. .. ..@ Polygons :List of 6 
    .. .. .. .. ..$ :Formal class 'Polygon' [package "sp"] with 5 slots 
    .. .. .. .. .. .. ..@ labpt : num [1:2] -118.4 33.4 
    .. .. .. .. .. .. ..@ area : num 0.0259 
    .. .. .. .. .. .. ..@ hole : logi FALSE 
##### Snipped rest of output ............................ 

Così, dopo aver cercato per un aiuto su fusione e la lettura:

?merge # and choosing the option for: 

Merge a Spatial* object having attributes with a data.frame 
(in package sp in library /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library) 

ho deciso di provare (e sembrano aver avuto successo:

> newobj <- merge(states, my_counts, by.x="STUSPS", by.y="State") 
Warning message: 
In .local(x, y, ...) : 8 records in y cannot be matched to x 

> names(newobj@data) 
[1] "STUSPS" "STATEFP" "STATENS" "AFFGEOID" "GEOID" "NAME"  
[7] "LSAD"  "ALAND" "AWATER" "count" 

L'avvertimento ha senso. Lei sembra avere un po 'più "Stati" non anticipato da dei che gli autori "stati" shp file:

> length(table(my_counts$State)) 
[1] 60 
> length(unique(states@data$STUSPS)) 
[1] 52 

La morale

Si dovrebbe guardare ai names -Valori nei due oggetti quando si si fondono:

> names(states) 
[1] "STATEFP" "STATENS" "AFFGEOID" "GEOID" "STUSPS" "NAME"  "LSAD"  
[8] "ALAND" "AWATER" 

> names(my_counts) 
[1] "State" "count" 

Answer 2

forse si dovrebbe aggiungere l'argomento "incomparabile", come nell'esempio:

"merge(x, y, by=intersect(names(x), names(y)), 

by.x = by, by.y = by, all.x = TRUE, suffissi = c (".x", ".y"), incomparabili = NULL, ...) "