Collegare R per spostamento verso il rosso con RPostgreSQL su Mac 10.11.3

Question

[post originale]

ho visto un paio di simili SO domande, ma non credo che nessuno di loro sono legati al sistema operativo.

Per farla breve, questo è quello che vedo quando provo a stabilire una connessione ssl con Redshift.

library(RPostgreSQL) 
drv <- dbDriver("PostgreSQL") 
con <- dbConnect(drv, 
       host = "XXXXXXXX.us-east-1.redshift.amazonaws.com", 
       port = 5439, 
       user = "XXXXXXXX", 
       password = "XXXXXXXX", 
       dbname = "db1") 

> Error in postgresqlNewConnection(drv, ...) : 
    RS-DBI driver: (could not connect XXXXXXXX@XXXXXXXX.us-east-1.redshift.amazonaws.com on dbname "db1") 

Ho provato quanto segue e nessuno di loro ha funzionato.

1. Connect to Redshift via SSL using R
2. Importing files from PostgreSQL to R
3. Connect to Postgres via SSL using R
4. https://groups.google.com/forum/#!topic/rpostgresql-dev/ELnVUJqjDbk

Ho un nodo di EC2 (Ubuntu) in AWS e un altro Mac Pro in carica, così ho cercato di utilizzare lo stesso codice connettersi da entrambi.

Il sistema Linux funziona con copia & che incolla lo stesso identico codice. Ecco il Sys.info() sul server Linux:

sysname            Linux 
release         3.13.0-48-generic 
version  #80-Ubuntu SMP Thu Mar 12 11:16:15 UTC 2015 
nodename         ip-xx-xxx-xx-xx 
machine            x86_64 
login            unknown 
user             bcui 
effective_user          bcui 

Tuttavia, il Mac Pro non riuscita con l'esatto messaggio di errore stesso. Ecco l'Mac Sys.info() (stesso che il mio computer portatile Mac):

sysname            Darwin 
release            15.3.0 
version      Darwin Kernel Version 15.3.0: 
          Thu Dec 10 18:40:58 PST 2015; 
         root:xnu-3248.30.4~1/RELEASE_X86_64 
nodename         bcui-MBP.local 
machine            x86_64 
login             bcui 
user             bcui 
effective_user          bcui 

Mi chiedo cosa potrebbe essere diverso tra la configurazione Mac e Linux che causa questo messaggio di errore?

[Aggiornamento 2016/02/10]

Ho provato a disinstallare tutti i file correlati R e, quindi reinstallare R da homebrew:

brew tap homebrew/science 
brew install R 

messaggio di errore Same:

> Error in postgresqlNewConnection(drv, ...) : 
    RS-DBI driver: (could not connect XXXXXXXX@XXXXXXXX.us-east-1.redshift.amazonaws.com on dbname "db1") 

FYI, posso collegarmi ad altri cluster Redshift non-ssl usando lo stesso codice, quindi potrebbe essere qualcosa relativo a openssl su Mac.

[Aggiornamento 2016/02/11]

Maggiori informazioni da @ commento di MasashiMiyazaki:

ho usato psql via CLI per la connessione e funziona benissimo. Inoltre, posso anche connettermi con successo usando il modulo Python psycopg2. Tuttavia, dovrò disabilitare questa linea da .bash_profile in modo per loro di lavorare:

export DYLD_LIBRARY_PATH=/usr/lib:$DYLD_LIBRARY_PATH 

Answer 1

Facendo un salto nel buio qui. Hai provato RPostgres?

installarlo in questo modo

# install.packages("devtools") 
devtools::install_github("RcppCore/Rcpp") 
devtools::install_github("rstats-db/DBI") 
devtools::install_github("rstats-db/RPostgres") 

Poi provarlo

library(DBI) 
library(RPostgres) 

con <- dbConnect(RPostgres::Postgres(), 
      host = "XXXXXXXX.us-east-1.redshift.amazonaws.com", 
      port = 5439, 
      user = "XXXXXXXX", 
      password = "XXXXXXXX", 
      dbname = "db1")