È possibile chiamare uno script R esterno da R markdown (.Rmd) in RStudio?

Question

E 'abbastanza banale per caricare gli script R esterni come da this R Sweave example:

<<external-code, cache=FALSE>>= 
read_chunk('foo-bar.R') 
@ 

Lo stesso può essere fatto per R Markdown?

Answer 1

Sì.

Mettete questo nella parte superiore del vostro R file di Markdown:

```{r setup, echo=FALSE} 
opts_chunk$set(echo = FALSE, cache=FALSE) 
read_chunk('../src/your_code.R') 
``` 

delimitare il codice con i seguenti suggerimenti per knitr (proprio come fa @yihui nella example):

## @knitr part1 
plot(c(1,2,3),c(1,2,3)) 

## @knitr part2 
plot(c(1,2,3),c(1,2,3)) 

In il tuo file R Markdown, ora puoi avere gli snippet valutati in linea:

Title 
===== 

Foo bar baz... 

```{r part1} 
``` 

More foo... 

```{r part2} 
```