Come si attraversa un file hdf5 utilizzando h5py

Question

Come si attraversano tutti i gruppi e i set di dati di un file hdf5 usando h5py?

Voglio recuperare tutto il contenuto del file da una radice comune utilizzando un ciclo for o qualcosa di simile.

Answer 1

visit() e visititems() sono i tuoi amici qui. Cf. http://docs.h5py.org/en/latest/high/group.html#Group.visit. Si noti che uno h5py.File è anche un h5py.Group. Esempio (non testato):

def visitor_func(name, node): 
    if isinstance(node, h5py.Dataset): 
     # node is a dataset 
    else: 
     # node is a group 

with h5py.File('myfile.h5', 'r') as f: 
    f.visititems(visitor_func)