h5py

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Errore apertura del file in H5PY (firma File non trovato)

Sto usando il seguente pezzo di codice per aprire alcuni file HDF5, prodotti in MATLAB, in pitone con H5PY: import h5py as h5 data='dataset.mat' f=h5.File(data, 'r') Tuttavia io sono ottenere il s

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Come comprimere il file hdf5 durante il ridimensionamento?

Ecco il mio codice: n = 100000 #This is what makes it tricky - lots of files going into this hdf5 file with h5py.File('image1.h5','w') as f: dset_X = f.create_dataset('X',(1,960,224,224),maxsh

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Come distinguere tra set di dati HDF5 e gruppi con h5py?

Uso il pacchetto Python h5py (versione 2.5.0) per accedere ai miei file hdf5. Voglio attraversare il contenuto di un file e fare qualcosa con ogni set di dati. Usando il metodo visit: import h5py de

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Aggiungere l'immagine raster al file HDF5 usando h5py

Mi scuso se questa è una specie di domanda per principianti, ma sono abbastanza nuova per Python e HDF5. Sto usando h5py, numpy e Python 2.7. Ho dati da vari file che devono essere importati in un fil

7calore

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Chiudere un file di dati h5py aperto

Nel nostro laboratorio memorizziamo i nostri dati nei file hdf5 tramite il pacchetto python h5py. All'inizio di un esperimento creiamo un file hdf5 e memorizziamo un array dopo l'array di array di dat

11calore

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Scrittura di un set di dati hdf5 di grandi dimensioni utilizzando h5py

Al momento, sto usando h5py per generare set di dati hdf5. Ho qualcosa di simile import h5py import numpy as np my_data=np.genfromtxt("/tmp/data.csv",delimiter=",",dtype=None,names=True) myFile="/

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setup.py h5py su Mac: File non trovato hdf5.h

sto costruendo h5py su Mac, seguendo le istruzioni "edificio contro HDF5 parallelo" in questo link: http://docs.h5py.org/en/latest/build.html $ export CC=mpicc $ python setup.py configure --mpi $ su

12calore

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Eliminazione del set di dati hdf5 utilizzando h5py

C'è un modo per rimuovere un set di dati da un file hdf5, preferibilmente usando h5py? O in alternativa, è possibile sovrascrivere un set di dati mantenendo intatti gli altri set di dati? Per la mia c

14calore

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'/' nei nomi di file HDF5 confusione

sto sperimentando alcune interazioni davvero strano tra h5py, PyTables (via Pandas), e C++ generati HDF5 file. Sembra che, h5check e h5py sembrano gestire i nomi di tipo contenenti '/', ma non lo è pa

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Come si attraversa un file hdf5 utilizzando h5py

Come si attraversano tutti i gruppi e i set di dati di un file hdf5 usando h5py? Voglio recuperare tutto il contenuto del file da una radice comune utilizzando un ciclo for o qualcosa di simile.