plyr

5calore

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Abitudini basate sulla rimodellanza con plyr: melt/cast vs. ddply

Sono abituato a fare melt e cast per tutto il tempo, e questa volta cerco un one-liner pulito. require(reshape) # first I melt some data: m <- melt(mtcars, id.vars = c("cyl", "am"), measure.vars = "

5calore

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costringere un'uscita multipla in una nuova dataframe utilizzando ddply

Ho questa funzione: > λ.est <- function(x){ mle.optim <- mle2(paretoNLL,start=list(λ=-0.7),data=list(x=x),trace=TRUE) return(summary(mle.optim)@coef[1,1:4]) } che corrispondono

8calore

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come accelerare questo codice R

Ho una data.frame (link to file) con 18 colonne e 11520 righe che trasformo simili: library(plyr) df.median<-ddply(data, .(groupname,starttime,fPhase,fCycle), numcolwise(median), na.rm=TRUE)

6calore

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Come posso generare statistiche di riepilogo per gruppo se la mia variabile di raggruppamento è un fattore?

Supponiamo di voler ottenere alcune statistiche di riepilogo sul set di dati mtcars (parte della versione R base 2.12.1). Di seguito, raggruppo le auto in base al numero di cilindri del motore che han

9calore

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Problema durante il caricamento del pacchetto plyr

Uso R 2.13.1 e ho tentato invano di caricare il pacchetto "plyr 1.6" in R. L'ho installato manualmente in una directory "~/R/library". Il mio codice è: .libPaths("~/R/library") library(plyr) ricevo

7calore

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Modo elegante per risolvere il task ddply con aggregato (sperando in prestazioni migliori)

Vorrei aggregare uno data.frame con una variabile identificativa chiamata ensg. Il frame di dati è simile al seguente: chromosome probeset ensg symbol XXA_00 XXA_36 XXB_00 1 X 4938842 ENSMUSG000

9calore

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Come utilizzare le variabili stringa per creare un elenco di variabili per ddply?

Utilizzando incorporato ToothGrowth esempio set di dati di R, questo funziona: ddply(ToothGrowth, .(supp,dose), function(df) mean(df$len)) Ma mi piacerebbe avere i fattori di sottoinsiemi siano vari

5calore

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Statistiche riassuntive con ddply

Mi piace scrivere una funzione utilizzando ddply che restituisce le statistiche di riepilogo basate sul nome di due colonne di data.framemat. mat è un grande data.frame con il nome di colonne "metric"

7calore

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Come si usa plyr per numerare le righe?

Fondamentalmente voglio una colonna id autoincremented in base alle mie coorti -. In questo caso (kmer, cvCut) > myDataFrame size kmer cvCut cumsum 1 8132 23 10 8132 10000 778 23 10 13789274

11calore

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Come utilizzare ddply per aggiungere una colonna a un frame di dati?

Ho un frame di dati che assomiglia a questo: site date var dil 1 A 7.4 2 2 A 6.5 2 1 A 7.3 3 2 A 7.3 3 1 B 7.1 1 2 B 7.7 2 1 B 7.7 3 2 B 7.4 3 ho bisogno di a