subprocess

6calore

4risposta

Come aderire alla stdout di due sottoprocessi e tubo per stdin di nuovo sottoprocesso in python

Diciamo che avevo il seguente comando che va dalla shell { samtools view -HS header.sam; # command1 samtools view input.bam 1:1-50000000; # command2 } | samtools view -bS - > output.bam # command

python subprocess samtools 2015-02-27

---

6calore

2risposta

Tubi multipli nel sottoprocesso

Sto tentando di utilizzare Sailfish, che accetta più file fastq come argomenti, in una pipeline ruffus. Eseguo Sailfish utilizzando il modulo subprocess in python, ma <() nella chiamata di sottoproces

python pipe subprocess named-pipes 2015-03-03

---

7calore

2risposta

Perché il sottoprocesso.Popen ha un limite di lunghezza dell'argomento inferiore a quello segnalato dal sistema operativo?

Sto eseguendo Python 3.4.3 su Linux 3.16.0. Voglio usare subprocess.Popen per eseguire un comando con un singolo argomento lungo (una complessa invocazione di Bash), circa 200 KiB. Secondo getconf e x

python linux python-3.x subprocess command-line-arguments 2015-04-22

---

19calore

2risposta

pitone sottoprocesso check_output restituito stato diverso da zero l'uscita 1

questi sono i miei codici di pitone: import subprocess subprocess.check_output("ls",shell=True,stderr=subprocess.STDOUT) import subprocess subprocess.check_output("yum",shell=True,stderr=subproces

python python-3.x subprocess 2015-01-13

---

6calore

2risposta

sottoprocesso file di errore

sto usando il modulo python subprocess di chiamare un programma e reindirizzare l'eventuale errore std a un file specifico con il seguente comando: with open("std.err","w") as err: subprocess.cal

python error-handling subprocess 2015-04-22

---

5calore

1risposta

subprocesso.check_output senza utilizzo di memoria elevato

Nel mio progetto corrente ho un server web che chiama comandi Linux per ottenere informazioni che vengono poi visualizzate sul sito web. Il problema che ho con questo è che il server web viene eseguit

python linux memory subprocess 2015-06-15

---

12calore

1risposta

Come ottenere sia il codice di ritorno sia l'output dal sottoprocesso in Python?

Durante lo sviluppo della libreria wrapper python per Android Debug Bridge (ADB), sto utilizzando il sottoprocessore per eseguire comandi adb nella shell. Ecco l'esempio semplificato: import subproces

python subprocess adb 2015-06-19

---

12calore

2risposta

Errore Python subprocess.Popen() (Nessun file o directory simile)

Sto cercando di contare il numero di righe in un file utilizzando le funzioni Python. All'interno della directory corrente, mentre os.system("ls") trova il file, il comando subprocess.Popen(["wc -l fi

python subprocess system popen 2015-05-03

---

10calore

2risposta

Come contare di codice il numero di file in un archivio utilizzando pitone

Nel programma io sostengo che è fatto come in: # count the files in the archive length = 0 command = ur'"%s" l -slt "%s"' % (u'path/to/7z.exe', srcFile) ins, err = Popen(command, stdout=PIPE, stdin

python python-2.7 subprocess popen 7zip 2015-06-29

---

5calore

2risposta

Chiamata di sottoprocesso Python con segno maggiore (>) non funzionante

Ho un eseguibile che accetta la stringa e restituisce un'altra stringa. Ora ho bisogno di alimentare un file come input e scrivere l'output in un altro file. Il comando standard è simile al seguente e

python subprocess popen 2015-07-06

---