2014-12-13 17 views
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Ho trovato peculiarità durante l'utilizzo della funzione predict e lm in R. Ho ottenuto risultati diversi per il frame di dati e il vettore per gli stessi dati . CodiceGetting Warning: "'newdata' ha avuto 1 riga ma le variabili trovate hanno 32 righe" su predict.lm in R

dataframe:

data(mtcars) 
fitCar<-lm(mtcars$mpg~mtcars$wt) 
predict(fitCar, 
     data.frame(x=mean(mtcars$wt)), 
     interval="confidence") 

uscita:

 fit  lwr  upr 
1 23.282611 21.988668 24.57655 
2 21.919770 20.752751 23.08679 
3 24.885952 23.383008 26.38890 
4 20.102650 19.003004 21.20230 
5 18.900144 17.771469 20.02882 
6 18.793255 17.659216 19.92729 
7 18.205363 17.034274 19.37645 
8 20.236262 19.136179 21.33635 
9 20.450041 19.347720 21.55236 
10 18.900144 17.771469 20.02882 
11 18.900144 17.771469 20.02882 
12 15.533127 14.064349 17.00190 
13 17.350247 16.104455 18.59604 
14 17.083024 15.809403 18.35664 
15 9.226650 6.658271 11.79503 
16 8.296712 5.547468 11.04596 
17 8.718926 6.052112 11.38574 
18 25.527289 23.927797 27.12678 
19 28.653805 26.519252 30.78836 
20 27.478021 25.554415 29.40163 
21 24.111004 22.715653 25.50635 
22 18.472586 17.319886 19.62529 
23 18.926866 17.799465 20.05427 
24 16.762355 15.452833 18.07188 
25 16.735633 15.423002 18.04826 
26 26.943574 25.112491 28.77466 
27 25.847957 24.198041 27.49787 
28 29.198941 26.963760 31.43412 
29 20.343151 19.242185 21.44412 
30 22.480940 21.268498 23.69338 
31 18.205363 17.034274 19.37645 
32 22.427495 21.219818 23.63517 

messaggio di avviso:

'newdata' had 1 row but variables found have 32 rows

Quando ho Separ mangiato fuori sia i dati nel vettore, ho ottenuto risposta diversa

Codice per il vettore

predict(fit,data.frame(x=mean(x)), interval="confidence") 

uscita:

fit lwr upr 
1 20.09 18.99 21.19 

Qual è la ragione di questa differenza?

risposta

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Questo è un problema dell'utilizzo di nomi diversi tra il tuo e il tuo newdata e non un problema tra l'utilizzo di vettori o dataframes.

Quando si adatta un modello con la funzione lm e quindi utilizzare predict per fare previsioni, predict cerca di trovare gli stessi nomi sul newdata. Nel primo caso, il nome x è in conflitto con mtcars$wt e quindi viene visualizzato l'avviso.

Vedi qui un esempio di quello che dico:

Questo è quello che hai fatto e non ha ottenuto un errore:

a <- mtcars$mpg 
x <- mtcars$wt 

#here you use x as a name 
fitCar <- lm(a ~ x) 
#here you use x again as a name in newdata. 
predict(fitCar, data.frame(x = mean(x)), interval = "confidence") 

     fit  lwr  upr 
1 20.09062 18.99098 21.19027 

vedere che in questo caso si adatta il proprio modello utilizzando il nome x e anche prevedere di usare il nome x nel tuo newdata. In questo modo non ricevi avvisi ed è quello che ti aspetti.

Vediamo cosa succede quando cambio il nome a qualcosa di diverso quando mi adatto del modello:

a <- mtcars$mpg 
#name it b this time 
b <- mtcars$wt 

fitCar <- lm(a ~ b) 
#here I am using name x as previously 
predict(fitCar, data.frame(x = mean(x)), interval = "confidence") 

     fit  lwr  upr 
1 23.282611 21.988668 24.57655 
2 21.919770 20.752751 23.08679 
3 24.885952 23.383008 26.38890 
4 20.102650 19.003004 21.20230 
5 18.900144 17.771469 20.02882 
Warning message: 
'newdata' had 1 row but variables found have 32 rows 

L'unica cosa che ho fatto oggi è stato quello di cambiare il nome x durante il montaggio del modello di b e poi prevedere utilizzando il nome x nello newdata. Come puoi vedere, ho ricevuto lo stesso errore della tua domanda.

Spero che questo sia chiaro ora!

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E perché mai ottengo lo stesso errore in questo caso? 'install.packages ("auto") libreria di (auto) i dati (Quartet) lmfit = lm (Quartetto $ Y2 ~ poli (Quartetto $ x, 2, crudo = TRUE)) NewData = data.frame (x = c (3,6,15)) predicono (lmfit, newdata, interval = "confidence", level = 0.95) ' – agaved

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@agaved Uno dei casi in cui si sta usando il nome completo del' Quartetto $ x' sarà cerca anche questo nel 'newdata'. Dato che non c'è alcun 'Quartet $ x' in newdata ma solo' newdata $ x' non riesce. – LyzandeR

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@agaved Inoltre, se hai una nuova domanda, per favore chiedi come nuova. Non usare commenti per porre domande diverse. Questo è un problema diverso da quello menzionato nella domanda. – LyzandeR

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Un modo per aggirare questo senza fare i nomi è quello di utilizzare il seguente:

fitCar<-lm(mpg ~ wt, mtcars) #here you use x as a name 
predict(fitCar,data.frame(wt=mean(mtcars$wt)), interval="confidence") 
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Nella formula per la funzione lm non si riferiscono alle variabili utilizzando il modello nomedataset $ variablename. Invece usa variablename + variablename ... Questo non getterà l'avviso: 'newdata' ha una riga (test) nrow ma le variabili trovate hanno righe (treno) nrow.